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统发育中剪接状态变化的
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作者:
alaminalamim
時間:
2023-8-5 11:57
標題:
统发育中剪接状态变化的
发展和细胞前缘中富集,而包含复杂性降低的事件的基因在一些复杂的形成中富集(图S 22 )。 图5 图5 拼接复杂性的演变。成对比较每个组织中直向同源事件的剪接熵时,人类和其他物种之间的斯皮尔曼相关性。对于每对物种,计算七个物种中所有直系同源外显子的剪接熵的相关性。B七个物种中每个组织的剪接熵最高的保守替代外显子的数量。C
线图显示每个组织进化过程中事件的剪接熵随着剪接熵的减
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少/增加而变化。D条形图显示每组最大剪接熵≥ 1.0 的替代外显子的比率。乙条形图显示每个年龄组事件的组织中剪接熵最大变化≥1.0的替代外显子的比率。VCA:脊椎动物保守的替代外显子;MCA:哺乳动物保守的替代外显子 全尺寸图像 通过固定影响剪接的突变,组成型外显子
是新的替代外显子的进化来源,这一过程被称为“交替化”[ 40 ]。因此,我们评估了“交替化”后外显子剪接熵的进化变化。总共分析了所有七个物种中 36,731 个一对一的直系同源 CE 事件以及估计的 Ψ 值。根据七个物种系时间,这些外显子被分为不同的类别。剪接年龄的估计是使用简约法进行的,遵循 Merkin 等人的方法。(2012) [ 12 ](图 S 23;参见方法)。通过比较六种组织中替代外显子的最大熵,我们发现
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